مدل محاسباتی جدید می تواند در ایجاد داروهای ضد سرطان کمک کند
محققان دانشکده پزشکی و انستیتوی پزشکی مولکولی (FIMM) در دانشگاه هلسینکی یک مدل محاسباتی با نام "امتیازبندی ضروری ترکیبی "(CES) تهیه کردهاند که شناسایی دقیق ژنهای اساسی در سلولهای سرطانی را برای تولید داروهای ضد سرطان امکان پذیر میکند.
چرا ژنهای اساسی در سرطان مهم هستند؟
سرطان عامل اصلی مرگ و میر در سراسر جهان است. سلولهای سرطانی معمولاً با فعال شدن برخی ژنها سریعتر رشد میکنند. درمانهای هدفمند با هدف مهار این ژنها که تنها در سلولهای سرطانی فعالند، ایجاد شده و در نتیجه باعث به حداقل رسیدن آسیب جانبی به سلولهای طبیعی میشوند.
غربالگری ژنتیکی با توان بالا برای ارزیابی اهمیت ژنهای اختصاصی برای بقای سلولهای سرطانی، ایجاد شده است. چنین رویکردی به محققان اجازه میدهد امتیاز ضروری ژن را برای تقریباً همه ژنها در طیف وسیعی از ردههای سلولهای سرطانی تعیین کنند.
Wenyu Wang از محققان این تیم تحقیقاتی میگوید: shRNA و CRISPR-Cas9دو روش معمول است که برای انجام غربالگری ژنتیکی با توان بالا استفاده میشود. با وجود کنترل کیفیت دقیق، امتیازات ضروری ژن در این دو روش برای همان ردههای سلول سرطانی با یکدیگر متفاوت هستند)).
برای هماهنگی دادههای غربالگری ژنتیکی، محققان این روش جدید محاسباتی (CES) را پیشنهاد کردند که ژن های ضروری سرطان را با استفاده از اطلاعات به دست آمده از shRNA و CRISPR-Cas9 به علاوهی ویژگیهای مولکولی سلولهای سرطانی پیشبینی میکند. این تیم نشان داد كه CES میتواند ژنهای اساسی را با دقت بالاتری نسبت به روشهای محاسباتی موجود تشخیص دهد. علاوه بر این، این تیم نشان داد که دو ژن اساسی پیش بینی شده در حقیقت با احتمال ضعیف به طور جداگانه برای بیماران مبتلا به سرطان پستان و لوسمی در ارتباط هستند. این موضوع پتانسیل آنها را به عنوان اهداف دارویی نشان میدهد.
یکی از محققان این تیم معتقد است که بهبود امتیاز ضروری ژن فقط یک آغاز است. هدف بعدی ما پیشبینی تداخل هدف دارو با ادغام حساسیت به دارو و خصوصیات اساسی ژن است. با توجه به حجم فزایندهای از مجموعه دادههای غربالگری عملکردی، ما امیدواریم که دانش خود در مورد خصوصیات داروها که در نهایت موجب کشف داروی مختص به هر فرد میشود را گسترش دهیم.
تاریخ انتشار: 14 نوامبر 2019
منبع: www.news-medical.net